Departemen Biologi adalah salah satu Departemen yang melaksanakan Program Studi Magister (PS S2) di Fakultas Ilmu Alam (FIA), Institut Teknologi Sepuluh Nopember (ITS). Visi, misi, tujuan dan sasarannya dirumuskan dengan berpedoman pada visi, misi, tujuan dan sasaran FIA dan ITS, sehingga ada kesinambungan dan konsistensi dari tingkat Departemen sampai dengan tingkat institut.

Visi, misi, tujuan dan sasaran dirumuskan berdasarkan masukan pihak eksternal (alumni, pengguna alumni dan stakeholder lainnya) serta pihak internal (dosen dan tenaga kependidikan) melalui rapat Departemen yang dihadiri oleh semua dosen dengan agenda bertahap, yaitu: