Sejarah logo HIMATIKA ITS terbentuk sekitar tahun 1994/1995. Pada saat itu HIMATIKA ITS mengadakan sayembara untuk membuat logo HIMATIKA ITS. Sayembara ini diprakarsai oleh Mas Gotri yang sekaligus menjadi jurinya. Padasaat itu, yang jadi pemenang adalah logo yang diajukan oleh kelompok JAMS. JAMS singkatan dari Jakarta-Ambon-Makasar-Surabaya, Anggotanya Michael Rudy Inuhanalias Micol, Gysber Tamaela alias Ambon, Ibonk, dan Adi Widodo H. Sesuai AD/ART HIMATIKA ITS tersebut mengandung makna:

1. Gabungan dari huruf S, T, danI yang membentuk lambing yang merupakan representasi bidang-bidang ilmu yang ada dijurusan matematika
2. S, T, danI merupakan singkatan dari Sains, Teknologi, dan Informasi
3. Lambang berwarna perak yang mempunyai arti kemurnian, ketentraman, dan bersifat dinamis (selalu mengalami perubahan sesuai perkembangan zaman)
4. Roda gigi berwarna biru tua dan muda berarti teknologi dengan latar belakang almamater