Tugas dan aktivitas Puslit Sains Fundamental adalah sebagai berikut :

• Melaksanakan kegiatan penelitian ilmiah terkini pada semua bidang sains fundamental, yang mengarah pada penemuan pengetahuan baru dan penciptaan perspektif baru tentang metode dan material.
• Melaksanakan publikasi ilmiah pada jurnal internasional bereputasi.
• Melaksanakan penelitian yang selaras dengan apa yang menjadi tantangan dan kebutuhan Indonesia saat ini dan menonjolkan potensi sumber daya yang dimiliki Indonesia.
• Melaksanakan penelitian prototype yang memiliki nilai komersial tinggi sebagai lanjutan dari pemanfaatan invensi dari penelitian sebelumnya, untuk nurturing penelitian inovatif.
• Membangun kerjasama penelitian, publikasi dan pengabdian masyarakat dengan perguruan tinggi lain dalam dan luar negeri, pemerintah dan swasta dalam bidang sains dan fundamental.
• Melaksanakan kegiatan pelatihan yang terkait dengan pengembangan sains dan fundamental.
• Mendorong peran serta Puslit Sains Fundamental dalam menghasilkan suatu produk inovasi yang termasuk dalam Prioritas Riset Nasional 2020-2024.