Departemen Teknik Biomedik didirikan berdasarkan SK Menristek dan Dikti Nomor: 102/M/Kp/III/2015 tanggal 30 Maret 2015. Secara singkat sejarah perjalanan Departemen Teknik Biomedik FTE-ITS dapat diringkas sebagai berikut:

1. Periode 1984 – 2014
Bidang studi Elektronika jurusan Teknik Elektro FTI-ITS (Bidang Keahlian Elektonika Biomedik ITS).

2. Periode Maret 2015
Program Studi Teknik Biomedik FTI-ITS.

3. Periode Januari 2017
Departemen Teknik Biomedik FTE-ITS.

4. Periode Januari 2020
Departemen Teknik Biomedik FTEIC-ITS.

5. Periode Juni 2022
Departemen Teknik Biomedik FTEIC-ITS dengan penambahan Prodi Teknologi Kedokteran.