Program Doktoral (S3) 

Departemen Teknik Perkapalan mendapatkan akreditasi (B) dari BAN-PT untuk kurun waktu 2013-2018. Gelar yang diperoleh lulusan adalah Doktor (Dr). Beban studi yang diwajibkan adalah 42 sks untuk mahasiswa yang berasal dari program magister yang sebidang dan dijadwalkan dalam 6 semester, serta 72 sks untuk mahasiswa yang berasal dari program magister yang tidak sebidang dan dijadwalkan dalam 8 semester. Beban studi untuk disertasi minimal 28 sks. Beberapa persyaratan yudisium lainnya; skor TOEFL minimal 500, dan jurnal nasional atau seminar internasional.