Dipimpin oleh Siti Nurkhamidah, ST., MS., Ph.D sebagai kepala laboratorium. Laboratorium ini bergerak dalam wilayah pengolahan limbah industri baik secara pengolahan biologis maupun secara fisik dan kimia. Adapun Penelitian unggulan yang dilakukan:

1. Study Tentang Pengaruh Inhibitor terhadap Laju Pertumbuhan Specifik Maksimum Denitrifikasi pada Proses Lumpur Aktif.
2. Pengolahan Limbah Lumpur aktif secara anaerobik dengan jaringan syaraf tiruan dan pemanfaatan gas bio sebagai substitusi energi.
3. Penurunan Kadar Ammonia Limbah Cair PT Petrokimia dengan Menggunakan Membran Cair Kerosene dengan jenis Surfaktan SPAN 80.
4. Kajian kinerja Dissolved Air Flotation (DAF) sistem kontinu terhadap penurunan kadar minyak dan COD Limbah Pertamina DOH Jawa Bagian Barat-Balongan
5.  Pembuatan biogas dari sludge
6. Studi Penghilangan warna Limbah Cair Industri Tekstil dengan menggunakan Alum, PAC atau MgCl2.
7. Removal siloxane dalam biogas dengan adsorber karbon aktif
8. Pengaruh H2O2 terhadap Pengolahan Limbah Formaldehid secara Biologis Aerobik
9. Study kinerja Dissolved Air Flotation terhadap penurunan kandungan minyak pada air limbah.
10. Adsorbsi Logam Berat Limbah Elektroplating dengan kulit udang
11. Pembuatan Biogas dari kotoran Sapi secara Anaerobik.
12. Klorinasi Limbah Berminyak

Topik penelitian meliputi:

1. Akuisisi Data
   Data yang saat ini ada di sekitar kita heterogen, baik dari sisi struktur (terstruktur dan tidak terstruktur), lokasi (terdistribusi atau terpusat), dari berbagai sumber/resource (contoh: data dari website, pesan teks/sms, dan lain-lain), serta volume (contoh: data masif atau big data).
2. Diseminasi Informasi
   Seiring dengan perkembangan sumber dan volume data, berkembang pula berbagai teknologi untuk mengolah data tersebut. Masing-masing dari teknologi tersebut merupakan implementasi dari paradigma yang berbeda mengenai data, dan diwujudkan dalam inovasi pada teknik-teknik pra-proses dan pengolahan data.
3. Paradigma Pengolahan
   Proses dan metode pengolahan data menjadi informasi yang lebih bernilai.